Manualmente no se pueden borrar archivos de la carpeta Winsxs, esta carpeta que es de sistema. En Winsxs se copia todo lo que contiene el DVD de instalación de Windows 7. La idea es que, en caso de que algún programa cambie una parte del sistema -de forma malintencionada como un virus o bienintencionada como un programa útil-, el sistema puede restaurarse y volver a ser estable, adicionalmente aquí queda copia de todas y cada una de las actualizaciones del sistema operativo que instala Windows Update, y de cada programa dll, de programas que instalas en el PC, este fue un problema que se solucionó con el lanzamiento del SP1 de Windows 7, con la instalación del "compcln.exe" el cual controla el crecimiento desmedido de Winsxs, sin embrago si tú tienes este sistema operativo desde su lanzamiento, es posible que hayan quedado estas copias almacenadas allí, y que algunas veces son solo peso muerto en el PC.
Para tratar de resolver el problema te recomiendo usar el siguiente comando en CMD:
1. Haz clic en Inicio
2. En buscar programas y archivos, digita cmd
3. Del listado de coincidencias en el icono cmd, haz un clic derecho y selecciona Ejecutar como administrador
4. En el command Promt o CMD, escribe el siguiente comando Dism /online /cleanup-image /Spsuperseded pulsa la tecla Enter. Este comando aunque pareciera que no está haciendo nada se ejecuta y después de un rato saldrá la barra de progreso.
5. Esto liberara el peso muerto de Winsxs
Luego ejecuta una limpieza de archivos de sistema:
1. Pulsa las teclas (Windows+E)
2. Selecciona en el icono del Disco duro (C): Con un clic derecho
3. Del menú selecciona Propiedades
4. En la pestaña General, selecciona Liberar espacio (espera a que se ejecute el análisis)
5. En el asistente del Liberador de espacio, haz clic en Limpiar archivos de sistema (espera a que se ejecute el análisis)
6. En la lista de archivos que se pueden eliminar, escoge Todas las opciones
7. Luego haz clic en Aceptar.
Con esto abras acabado de liberar el resto del espacio de la carpeta Winsxs y otros archivos de sistema, que son peso muerto en el mismo, dando un poco más de capacidad al disco.
Fuente: answers.microsoft.com
Enlace relacionado: Liberar espacio en Disco. Reducir Carpetas WinSxS e Installer